侵占5000元能不能立案，需要根据具体情况和地方司法机关的规定来确定。
侵占5000元是否立案，取决于具体情况和地方司法机关的规定。一般而言，侵占罪的立案标准是数额达到5000元或以上，但有些地方可能将立案标准设定在一万元。职务侵占罪的立案标准通常是挪用本单位资金数额在五千元至一万元以上，或者挪用资金数额较小但超过三个月未还、用于营利活动或非法活动的情况。因此，侵占5000元是否构成犯罪并立案，需要结合当地的具体司法解释和实践来判断。
侵占罪的立案标准：
1、案件性质：必须是侵占公私财物的行为；
2、犯罪主体：侵占行为人通常是对财物有管理、使用权的人；
3、犯罪客体：侵占的对象必须是公私财物；
4、犯罪数额：是否达到当地规定的立案标准，通常以数额较大为标准；
5、犯罪手段：采用隐瞒、欺骗等手段非法占有财物；
6、犯罪结果：造成财产所有权人损失的实际后果。
综上所述，侵占5000元能否立案取决于具体情况和地方司法机关的规定，一般而言，立案标准是数额达到5000元或以上，但不同地方可能有不同的标准。
【法律依据】：
《最高人民、关于机关管辖的刑事案件立案追诉标准的规定（二）》
第八十四条
公司、企业或者其他单位的人员，利用职务上的便利，将本单位财物非法占为己有，数额在五千元至一万元以上的，应予立案追诉。国有公司、企业或者其他国有单位中从事公务的人员和国有公司、企业或者其他国有单位委派到非国有公司、企业以及其他单位从事公务的人员有前款行为的，依照本法第三百八十二条、第三百八十三条的规定定罪处罚。